Блог о ДНК-тестах и генетической генеалогии | Генопоиск

Strelka новое слово в исследовании Y хромосомы

Практика Наука

Strelka: Y-панель для тех, кому нужно больше, чем STR, но пока не нужен полный геном

STRELKA — это специализированная панель анализа Y-хромосомы, объединяющая два ключевых подхода генетической генеалогии:

  • STR-маркеры (Short Tandem Repeats) — для сравнительной генеалогии и поиска родственников.
  • SNP-мутации (Single Nucleotide Polymorphisms) — для точного определения положения в филогенетическом дереве Y-хромосомы.

Панель занимает промежуточное положение между простыми STR-тестами (которые дают только гаплотип) и полногеномным секвенированием (WGS). Она даёт больше, чем STR, но значительно дешевле и быстрее, чем WGS, хотя и уступает ему по глубине и объёму данных.

2. Технологическая логика панели

STR-компонент

Панель включает 67 Y-STR маркеров.
STR-маркеры представляют собой короткие повторяющиеся участки ДНК, количество повторов в которых варьирует между людьми.
Эти маркеры:
  • используются для поиска совпадений между тестируемыми;
  • позволяют оценивать степень родства по мужской линии;
  • применяются в генеалогии и судебной генетике.
STR-подход используется в коммерческих тестах уже более 20 лет.

SNP-компонент

Вторая часть панели — около 1840 SNP-мутаций Y-хромосомы.
SNP-мутации возникают редко и практически не изменяются со временем.
Поэтому они используются для построения филогенетического дерева Y-хромосомы.
SNP-панель позволяет:
  • определить точный субклад гаплогруппы
  • определить положение на дереве Y
  • различать линии возрастом тысячи лет

3. Почему STRELKA лучше обычных STR-тестов

Стандартные тесты (например Y-37 или Y-111) анализируют только STR-маркеры.
Это создаёт ряд ограничений:
ОграничениеПричина
Невозможно точно определить субклад
STR не фиксируют древние мутации
Сложно различать линии старше ~1000 лет
STR быстро мутируют
Нет связи с научным деревом Y-хромосомы
используется только генеалогическая дистанция
Добавление SNP-панели решает эти проблемы.
Теперь тест:
  • определяет точный субклад
  • связывает результат с глобальным деревом Y
  • позволяет реконструировать историю рода

4. Почему STRELKA дешевле WGS

Whole Genome Sequencing (WGS) анализирует весь геном человека.
Это:
  • ~3,2 миллиарда нуклеотидов
  • около 60–100 Гб сырых данных
Стоимость WGS выше, потому что требуется:
  • глубокое секвенирование всего генома
  • огромный объём вычислений
  • хранение больших файлов
В STRELKA анализируется только Y-хромосома и только информативные участки.
Это уменьшает:
  • объём секвенирования
  • стоимость анализа
  • время обработки

5. Чего Strelka не даёт (это важно)

Характеристика
Y-50 STR
Strelka
WGS Genopoisk
Количество STR
50
>67
Тысячи
Количество SNP
ограниченная предикция
>1800
Миллионы
Цена
7600 т.р.
16 т.р.
50-79 т.р.
Точность
Базовая
Высокая
Максимальная
Сроки
4 недели
5--6 недель
8-10 недель
Для кого
Новички
Продвинутые
Профессионалы
Чтобы не было разочарования после получения результата:


Терминального SNP (уровень YFull)

Панель не секвенирует весь Y, только 1840 позиций. Для терминального снипа нужен WGS.

Загрузки в YFull

YFull принимает только BAM от WGS или VCF от специализированных панелей, с которыми они работают. Strelka в этот список не входит.

Загрузки в FTDNA

FTDNA закрыла приём сторонних VCF несколько лет назад. Ваши STR вы сможете использовать в сторонних базах (YSearch, Semargl), но не в экосистеме FTDNA.

Аутосом, митохондрии, данных о здоровье

Это панель только на Y-хромосому.

Если вам нужен терминальный SNP, доступ в YFull и полный набор данных на будущее — берите WGS. Если вы хотите быстро, дёшево и с хорошей глубиной для Северной Евразии узнать свою ветку и получить STR для сравнения — Strelka подходит идеально.

6. Для кого предназначена панель

Для кого Strelka — хороший выбор

Ваш сценарийStrelka подходит?

Вы участник фамильного или этнического ДНК-проекта. Нужно протестировать много людей дёшево и быстро, чтобы понять, кто к кому относится и какие гаплогруппы в группе.

Идеально

Вы хотите узнать свою Y-гаплогруппу глубже, чем "R1a" или "N", но не гонитесь за терминальным SNP.

Хорошо

Вы собираетесь загружать результаты в YFull или FTDNA.

Нет, берите WGS

Вам нужны аутосомные данные (поиск родственников по всем линиям), митохондрия или данные о здоровье.

Нет, берите WGS

Вы хотите получить данные "на вырост" — через 5 лет появится новый референс, и вы сможете переанализировать.

Нет, только WGS даёт сырой BAM

7. Обработка данных

Коллинг STR и SNP выполняют специалисты, работающие с инфраструктурой YFull — одной из ведущих мировых платформ по анализу Y-хромосомы. Это гарантирует корректную фильтрацию мутаций и определение субклада.

Важное уточнение: Это не означает, что ваш образец попадёт в публичное дерево YFull. Для этого нужен BAM-файл от WGS. Сотрудничество с YFull касается только калибровки алгоритмов и качества интерпретации.

8. Главное преимущество панели STRELKA

Strelka — единственная на российском рынке Y-панель, которая целенаправленно отбирала SNP под популяции Северной Евразии и одновременно даёт большой набор STR для генеалогических сравнений.

Она не пытается заменить WGS. Она решает свою задачу: быстро и за адекватные деньги дать ответ, который для многих пользователей является достаточным — узнать свою ветку до 2-4 субклада и иметь STR для поиска "своих" в проектах.Ключевая особенность панели STRELKA — объединение двух генетических подходов в одном анализе:
Участие специалистов YFull в интерпретации данных обеспечивает:
  • корректный SNP-коллинг и фильтрацию мутаций
  • точное определение субклада Y-хромосомы
  • коллинг STR

Уникальное сочетание параметров

Strelka — это честный, сбалансированный инструмент для массового скрининга Y-линий внутри проектов и для тех, кому WGS избыточен. Она не обманывает ожиданий, если вы понимаете её ограничения. А ограничения у неё ровно такие: нет терминального SNP, нет загрузки в YFull/FTDNA, нет данных на будущее. Но для своей цены и скорости она даёт максимум возможного, особенно в реалиях российского рынка генетической генеалогии.

На рынке существуют решения, которые предлагают лишь одну из этих возможностей либо стоят значительно дороже.